一群疯狂的科学家,为了自己的梦想,研制出一套只需要少许基因便可复制出宠物小精灵的机器,并把发掘到的世界最强宠物小精灵——梦幻的睫毛,复制成了拥有比梦幻更强能力的——超梦但当超梦醒来后,却因无法找寻到真正的自我而暴走,将岛屿上的研究所夷为平地。这时候,火箭队的老大出现在超梦的面前,用花言巧语把迷失自我的超梦拉拢过来为自己办事,但没过多少时间,超梦再次对自我感到迷茫,也彻底对利用他的人类感到失望,爆炸在火箭队老大基地又一次出现,超梦也离去了,回到那个复制它的岛屿,决定开始它的复仇之战。另一方,正在草原野餐的小智一行,也迎来了他们新的故事……《精灵宝可梦剧场版合集》故事主线非常新颖,动漫围绕成长和找回童真为核心,整体充满了人类永恒不变的情感,配音表现惊艳,影片的设计比迪士尼的作品更精彩。画风动态效果非常逼真,角色设计多彩精细,剧情看起来完全不幼稚或者沉闷,特效无可挑剔,是一部大胆创想,打动人心的动画片。